セメダインでもボンドでも、別にクリヤーでなくても良いのですが、私は線路を固めるときは、写真のようなボンドを使っています。
工法として、薄い石膏膜の下は発泡スチロールですので、釘止めがほとんど無効になります。だから、接着剤でしっかり固める必要がでてきます。